Contribution à l’étude de Fusarium oxysporum f sp albedinis agent causal de la fusariose vasculaire du palmier dattier et moyens de lutte.

Abstract

Le palmier dattier (Phœnix dactylifera L.) est le pilier des écosystèmes oasiens. Par sa présence dans ces zones désertiques, permis le maintien de diverses formes de vies animales et végétales. Le Bayoud une fusariose vasculaire causée par un champignon phytopathogène Fusarium oxysporum f sp albedinis (FOA) menaces l’existence de cette culture en ces régions arides. La présente étude vise principalement à la caractérisation de l’agent de la fusariose vasculaire du palmier dattier par des outils biomoléculaires et la recherche de molécules bioactives issues de la pyrolyse de 3 bois contre le FOA pour un essai de lutte biologique. 11 isolats de FOA ont été collectés à partir de 9 clones de dattier sur 10 oasis du sud-ouest Algérien. L’identification et l’analyse moléculaire par PCR avec les marqueurs spécifiques FOA (TL3-FOA28) et (BIO3-FOA1) a montré que tous les isolats sont génétiquement identiques et appartiennent tous au FOA. L’analyse des séquences a permis la construction d’une bibliothèque de clones de Fusarium oxysporum albedinis. Les 11 isoltas de FOA ont subis une autre caractérisation biomoléculaire par marqueurs PCR (LROR /LR3) et des séquençages ont étaient réalisés dont les séquences et leurs numéros d’accès GenBank sont : L2Fb1 (MG209822.1), L2Fb2 (MG209823.1), L2Fb4 (MG209824.1), L2Fb6 (MG209825.1), L2Fb10(MG209826.1), L2Fb15 (MG209827.1), L2Fb18 (MG209828.1), LAFO1 (MG209829.1), LAFO2 (MG209830.1), LAFO3 (MG209831.1), LAFO4 (MG209832.1), LAFO5 (MG209833.1),LAFO 10 (MG209834.1), LAFO 12 (MG209835.1), LAFO 15 (MG209836.1), LAFO 16 (MG209837.1). L’analyse de ces séquences a permis la construction d’une bibliothèque de clones L’analyse de ces banques de gènes révèle un degré de polymorphisme plus élevé que prévu dans GenBank à partir des séquences disponibles, une séquence d'une espèce distincte Fusarium inflexum (U34548.1) c’est regroupé avec les séquences de Fusarium oxysporum. La fabrication en laboratoire de goudron végétale issu par pyrolyse du bois d’Acaciaraddiana, Jeniperus oxycedrus et Jeniperus phoeniceaà donner des rendements très variés, ces goudrons sont utilisés comme source des molécules anti FOA, Les résultats d'activité antifongique révèlent que les échantillons des goudrons (T1, T2) inhibent totalement la croissance des isolats du pathogène de Fusarium oxysporum f spalbedinis testés respectivement à 6.33mg/ml et 6.81mg/ml. L’autobiographie a permis de révélée 3 molécules anti FOA,Les techniques CG/MS et RMN ont permet de caractériser 3 diterpènes : Acide Pimarique (PA), Acide Abiétique (DA)et Acide Dehydroabiètique(DHA), l’étude leurs CMI est très intéressante et révèle des valeurs presque pharmacologiques 21ug/ml pour PA, 16.8ug/ml pour DA et 9ug/ml DHA. L’essai de lutte biologique en sol avec ces molécules à révéler une forte capacité de limiter la germination des spores de FOA voir les détruire totalement pour une dose de 1.55 % de DHA durant 2 mois de traitement.