Diffraction X et modélisation moléculaire d’un nouveau composé organique

Abstract

Le travail présenté dans ce manuscrite consacré a l’étude de la répartition de la distribution de la densité de charge obtenue à partir des données de diffraction des rayons X haute résolution sur monocristal à basse température (173 K), dans un composé organique : Le L-Alanine-L-Méthionine. Cette étude nécessite tous d’abord la détermination de la structure du composé étudié dans la quelle on a utilisé les deux méthodes ( la modélisation moléculaire et la technique de diffraction x haute résolution sur monocristal ), Nous avons présenté également le mouvement thermique et l'analyse structurale obtenue à partir de l'affinement des moindres carrés basé sur F ² et la distribution de la densité électronique obtenue à partir du modèle multipolaire.la connaissance de la densité de charge précise ainsi que les paramètres d’agitation thermique de notre molécule nous a permis de remonter aux grandeurs physiques électrostatiques du composé, telles que les charges nettes atomiques, le gradient du champ électrostatique au voisinage de la molécule ainsi que le moment dipolaire., les cartes de densité expérimentale et dynamique du composé étudié sont représentées. La bonne qualité des cartes de densité obtenues témoigne de la qualité des données de diffraction X ainsi que la validité du modèle utilisé – modèle multipolaire de Hansen-Coppens – qui est actuellement le plus utilisé. La méthode DFT avec les deux fonctionnelles utilisées pour les calculs théoriques donne des résultats en bon accord avec ceux de l’expérimentation. En outre, les propriétés moléculaires de la molécule L-Alanine-L-Méthionine sont déterminées par une combinaison de caractérisation spectroscopique (déplacements chimiques FT-IR) et les calculs théoriques. Les fréquences de vibration, sont étudiés en utilisant les fonctionnels B3LYP avec la base 6-311++G (d, p) dans l'état fondamental et comparés aux valeurs expérimentales. Chaque fréquence de vibration est attribuée sur la base de la distribution d'énergie potentielle (PED).. Le gap énergétique entre les énergies des orbitales moléculaires les plus hautes occupées (HOMO) et les énergies des orbitales moléculaires les plus basses vacantes (LUMO) est obtenu en calculant les orbitales moléculaires frontières en utilisant les niveaux de calcul B3LYP / 6-311++G (d, p). Les charges atomiques de Mulliken et le potentiel électrostatique moléculaire (MEP) sont déterminés afin de trouver les sites les plus réactifs pour les attaques électrophiles et nucléophiles