Contribution à la caractérisation de Ascochyta rabiei (Pass.) Labr., agent causal de l’anthracnose du pois chiche (Cicer arietinum L.) et étude de son interaction avec Medicago truncatula Gaertn.

Abstract

Seize isolats de Ascochyta rabiei (Pass.) Lab, champignon responsable de l’anthracnose du pois chiche (Cicer arietinum L.), récoltés dans six régions du nord-ouest algérien montrent une variabilité culturale, morphologique et pathogénique. L’étude pathogénique a mis en évidence l’existence d’un pathotype III (très agressif) dans deux régions différentes. L’étude moléculaire basée sur l’utilisation des amorces microsatellites, (M13), (ATC)5, (GAA)5, (TGTC)4, n’a pas permis de déceler un quelconque polymorphisme, en revanche, les amorces MAT ont révélé l’existence de deux mating type (MAT1-1 et MAT1-2) dans la plupart des régions. L’inoculation de Medicago truncatula, plante modèle des légumineuses, par le pathotype II (moyennement agressif) de A. rabiei montre que celui-ci est un parasite potentiel de cette plante. L’expression de 9 gènes de défense chez deux lignés de M. truncatula (A17 et F83005.5) est étudiée par qRT-PCR. Ces gènes représentent des: PR protéines, phytoalexines, et inhibiteurs de protéase. Ils peuvent contribuer chacun soit directement soit indirectement à la défense contre des attaques de pathogènes. Les protéines de défense (PR5 et chitinase) montrent des profils d’expression différents chez les deux lignées. Les gènes codant pour les protéines de défense, PR1, β-1,3-Glucanase et le gène Pi20 inhibiteur des protéinases à sérine montrent des profils d’expression similaires chez les deux lignées. Le gène codant la PR10 et trois gènes impliqués dans la voie de biosynthèse des flavonoïdes, la phénylalanine ammonia-lyase (PAL), la flavone synthase (FS) et la chorismate synthase (CS) ne montrent pas de modification significative dans leur expression. La PR5 peut constituer un bon marqueur de résistance chez M. truncatula.. Abstract Sixteen isolates of Ascochyta rabiei (Pass.) Lab. used in this study were obtained from blight infected chickpea plants collected from six regions of northwestern Algeria. They show cultural, morphological and pathogenic variability. Pathogenic study revealed the existence of a pathotype III (very aggressive) in two different regions. Molecular study based on the use of microsatellite primers, (M13), (ATC) 5, (GAA) 5, (TGTC) 4, did not detect any polymorphism. On the other hand the MAT primers reveal occurrence of two mating types (MAT1-1 and MAT1-2) in most regions. Inoculation of Medicago truncatula, a model plant of legumes, by pathotype II of A. rabiei (moderately aggressive) shows that this is a potential parasite of this plant. The expression of 9 defense genes in two M. truncatula lines (A17 and F83005.5) is studied by qRT-PCR. These genes represent: RP proteins, phytoalexins, and protease inhibitors. They can contribute either directly or indirectly to defense against attacks by pathogens. The defense proteins (PR5 and chitinase) show different expression profiles in both lines. The genes encoding the proteins PR1, β-1,3-Glucanase and Pi20 gene which inhibit serine proteinases, show similar patterns of expression in both lines. The gene encoding PR10 and three genes involved in the flavonoid biosynthesis pathway, phenylalanine ammonia-lyase (PAL), flavone synthase (FS) and chorismate synthase (CS) show no significant change in their expression. PR5 may be a good marker of resistance in M. truncatula..

. ملخص : واحد من أكثر الأمراض Ascochyta rabiei (Pass.)Labr. یعتبر التبقع الأسكوكیتي الناجم عن الفطر في الجزائر. (Cicer arietinum L) الضارة لنبات الحمص من ست ة مناطق واقع ة في شمال غرب Ascochyta rabiei (Pass.) Labr تم عزل ستة عشر عزلة ل الجزائر، لدراسة تنوعھا من حیث الشكل المرفولوجي، تنوعھا الإمراضي ونوع اقتران. جد عدواني في منطقتین (pathotype III) الدراسة الإمراضی ة سلط ت الضو ء عل ى وجو د نم ط ممرض اا ا مختلفتین. لا تسمح بكشف أي متعدد الآشكال من (TGTC)R4R, (GAA)R5R, (ATC)R5R, M الدراسة المستندة على إستعمال 13 فتم الكشف ،MAT-1- و 1 MAT-1- تكشف وجود نوعین من التزاوج 2 MAT ناحیة أخرى. الدراسة للنوع الجنسي عنھما في معظم المناطق . تبتت نموذج من البقولیات عن طریق نمط ممرض اا متوسط (Medicago truncatula) تلقیح الفصة البرمیلیة یبین آ ن ھدا الأخیر یمثل طفیلي محتمل لھده النبتة. ، (Ascochyta rabiei) العدوانیة للإ سكوكیطة رابي qRT-PCT المدروس عن طریق (A و ( 17 (F التعبیر عند تسعة جینات مقاومة عند الفصة البرمیلیة ( 83005.5 فیتوألكسین و مثبط البروتییاز یمكنھم المساھمة بطریقة مباشرة أو غیر مباشرة في ,PR أن ھده الجینات تمثل بروتینات الدفاع عن الھجمات الممرضة. و شیتیناز) تبرز ملا مح تعبیر مختلفة عند النوعین من الفصة، الجینات المرمزة لبروتینات PR بروتینات الدفاع ( 5 المثبطة لبروتیناز السرین تبرز ملامح تعبیر مماثلة عند النوعین من Pi -3,1- قلیكوناز و جنیة 20 β و PR الدفاع 1 الفصة. الجنیة المرمزة بالإضافة إلي ثلاثة جینات مشاركة في طریقة التركیب البیولوجي للمركبات الفلافونیة، الفنیل لا تبرز أي تغییر موثق في تعبیرھا. (CS) و الكریسمزسنتاز (FS) الفلافون سینتاز ، (PAL) ألانین أمونیالیاز یمكن أن یمثل محدد نوعي للمقاومة عند الفصة البرمیلیة. PR5.