Etude Structurale d’un Composé Organique par DRX et Modélisation Moléculaire

Abstract

Nous rapportons ici la structure cristalline du composé organique (5Z)-5-(4- Chlorobenzylidene)-1,3-thiazolidine-2,4-dione . La molécule étudiée appartient à la famille des thiazoles de la formule chimique C10H6ClNO2S. Cette structure a été déterminée par diffraction des rayons X. Le composé cristallise dans le groupe d'espace P 21 /n du système monoclinique avec Z = 4, les paramètres de mailles sont : a = 3.9098 (1) Å, b = 40.7555(15) Å, c = 6.0917(2) Å, α = 90°, β = 93.748 °, γ = 90°, V = 968.61 (5) Å. La structure cristalline a été affinée jusqu'à un résidu R de 0,0355 pour 1885 réflexions observées. Nous avons entamé une étude théorique en utilisant le programme Gaussien. Les calculs théoriques ont été réalisés à l’aide de théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT) avec la fonctionnel B3LYP en utilisant la base de calcul 6-311G (d, p). Le calcul des distances interatomiques, des angles de valence et de torsion ont été effectué à l'aide du programme SHELX. Par comparaison entre les résultats de la modélisation moléculaire et ceux de la diffraction des rayons X, nous avons pu constater en général que l’écart dans ces valeurs entre théorique et expérimental sont presque identique. Ces dernières témoignent la qualité des données de l’enregistrement. Mots clés : DRX,DFT , SHELX, Gaussien ,modélisation moléculaire - Abstract : We report here the crystal structure of the organic compound (5Z)-5-(4- Chlorobenzylidene)-1,3-thiazolidine-2,4-dione . The studied molecule belongs to the thiazole family with the chemical formula C10H6ClNO2S. This structure was determined by X-ray diffraction. The compound crystallizes in the space group P 21 /n of the monoclinic system with Z = 4, the mesh parameters are: a = 3.9098 (1) Å, b = 40.7555(15) Å, c = 6.0917(2) Å, α = 90°, β = 93.748 °, γ = 90°, V = 968.61 (5) Å. The crystal structure was refined to an R residue of 0.0355 for 1885 observed reflections. We started a theoretical study using the Gaussian program. Theoretical calculations were performed with the help of density functional theory (DFT) with the B3LYP functional using the 6-311G (d, p) calculation basis. The calculation of interatomic distances, valence and torsion angles was performed using the SHELX program. By comparison between the results of the molecular modeling and those of the X-ray diffraction, we could note in general that the difference in these values between theoretical and experimental are almost identical. The latter testify the quality of the data of the recording. Key words: DRX, DFT, SHELX, Gaussien, molecular modeling.RESUME ملخص : نبلغ هنا عن التركيب البلوري للمركب العضوي )-5- (4-Chlorobenzylidene) -1.3-(5Z ثيازوليدين --2.4ديون. ينتمي الجزيء الذي تمت دراسته إلى عائلة الثيازول من الصيغة الكيميائية . C10H6ClNO2Sتم تحديد هذا الهيكل من خلال حيود الأشعة السينية. المركب البلوري في مجموعة الفضاء P 21/nمن النظام أحادي العمود مع ، Z = 4البارامترات الشبكية هيb = ، a = 3.9098 (1) À V = ،γ = 90 ° ،β = 93.748 ° ،α = 90 ° ،c = 6.0917 (2) À ،40.7555 (15) À 99oتم تنقيح الهيكل البلوري إلى بقا R ʮمن 0.0355لانعكاسات 1885التي لوحظت. بدأ ʭدراسة نظرية ʪستخدام برʭمج . Gaussianأجريت الحساʪت النظرية ʪستخدام نظرية الكثافة الوظيفية ) (DFTمع B3LYPالوظيفية ʪستخدام أساس G 311-6الحساب .) (d, pتم حساب المسافات بين الذرات وزواʮ التكافؤ والالتواء ʪستخدام برʭمج .ʪ SHELXلمقارنة بين نتائج النمذجة الجزيئية ونتائج حيود الأشعة السينية، تمكنا من ملاحظة بشكل عام أن في هذه القيم بين النظرية والتجريبية متطابقة تقريبا. ويشهد هذا الأخير على جودة بياʭت السجل. الكلمات المفتاحية: ،Gaussian ،SHELX ،DFT ،DRXالنمذجة الجزيئية