Structure moléculaire de substances organiques et relation avec leur activité biologique

Abstract

Dans ce travail, la structure 4-((2R)-2-(3,4-dibromophenyl)-1-fluorocyclopropyl)-N- (o-tolyl) benzamide (DBFB) a été déterminée à température ambiante en utilisant des données de diffraction des rayons X sur monocristal. La structure du composé a été résolue en utilisant 1464 réflexions observées avec I ≥ 2σ (I). Le composé cristallisé dans le groupe d'espace P 21 du système monoclinique, avec a= 20.0820(10), b= 10.2770(10), c= 4.860(2) Å, β= 95.9600(10)°, V= 997.6(4) Å3, Z = 2, Dc= 1.675 g/m3, F(000) = 500, Μr= 503.18, μ= 4.09 mm-1 et le R final = 0,0639, l’empilement moléculaire est assurée par des liaisons hydrogène C – H⋅⋅⋅O et C – H⋅⋅⋅F formant un réseau supramoléculaire dans la maille élémentaire. En outre, une analyse conformationnelle a été effectuée afin de confirmer le conformère le plus stable de la molécule. Les paramètres géométriques du céto-conformère dans l'état fondamental ont été obtenus en utilisant la méthode de la théorie fonctionnelle de la densité (DFT) avec le niveau de théorie B3LYP / 6-31G (d, p). En général, Il y a un bon accord entre les valeurs expérimentales et les résultats calculés. Des calculs de la chimie quantique ainsi que de spectroscopie IR ont permis d’attribuer des fréquences à différentes vibrations de la molécule. Les orbitales moléculaires frontières (HOMO et LUMO), descripteurs de réactivité, ont été évalués et discutés. Les charges atomiques de Mulliken et le potentiel électrostatique moléculaire (MEP) sont déterminés afin de trouver les sites les plus réactifs pour les attaques électrophiles et nucléophiles. L'activité biologique de la molécule DBFB a été testée contre l'enzyme acétylcholinestérase (MdAChE) en utilisant le docking moléculaire. Le composé DBFB présente une bonne activité d'inhibition.